Hola,
He entrado con IE, se ve muy mal, es raro, esa plantilla está hecha para que se vea bien en IE8, ni siquiera con el la compatibilidad IE7 se ve bien. Nos has cambiado el css, no?
No sé dónde estará el fallo, yo diría que es de algún plugin, los módulos parecen están bien. Prueba si quieres a desactivar todos los plugins y mirar con IE, si se ve bien es por algún de ellos así que es cuestión de ir publicándolos poco a poco hasta que encuentres el que jode el sistema. Si se ve mal al quitar los plugins prueba lo mismo con los módulos.
Otra cosa que puedes hacer es probar con otra plantilla, con Joomla vienen dos más, si se ve mal con ellas es algo de la web. Yo siempre que busco una plantilla lo hago en
bestofjoomla, marcándolo que sea válido el html y css para que se vea bien en todos los navegadores.